Суть проблемы: под обычной нагрузкой все летает, даже при большой посещаемости. Но на сайты переодически происходит DDOS атака от конкурентов, как я понимаю с бот-нет сетей контролируемая вручную - как только я нахожу способ заблокировать текущий вариант атаки, они меняют ее на другой.Не надо лепить лыжи из соломы. Становись под защиту. Похлеще чем у тебя атаки сдерживают.
На сервере настроен fail2ban правила в котором я переодически меняю, чтобы подстроиться под изменяющуюся атаку.
Сейчас сайты находятся на старом сервере с примерно таким же железом, но более старым софтом (Apache FCGI, PHP5, без Nginx):.....