sim3x

@FireGM в статье есть конфиг uwsgi. Раскоменти
# chmod-socket = 664
Дважды проверь все пути к сокетам, как они могут читаться nginx пользователем и пользователем под которым uwsgi запущен.

Чтобы не было вопросов - почитай, что из себя представляет битовая маска прав

Устанавливать глобально uwsgi лучше в режиме "tyrant"

Искать в этом направлении

location / {
   root /documentRoot;
   try_files msk/ shared/;
}

Были ли у вас такие проблемы?

ну вот

Windows Server 2012.

смущает сильно

Конфиг фпм какой?

Статическая vs динамическая линковка

Как вариант, чтобы исследование не проходило впустую, подключите родной репозиторий nginx
http://nginx.org/packages/ubuntu/dists/
deb + deb-src
, а сборку делайте из сорцов репозитория

sudo apt-get source nginx

gulpjs.com
make
bash
...

Если js, css будут по 10 метров, то и крутым браузерам может поплохеть

combine->minimize->gzip -9