Нужно отделить логику чтения файла от логики его обработки — мало ли откуда данные могут придти — из БД, по сети, в качестве параметра метода.
Т.е. обработчик должен на входе принимать строку (а ещё лучше какой-нибудь поток байт/символов для последовательного чтения).
В этом случае юнит-тестирование сведётся к тестированию только логики процессинга, а, следовательно, данные могут быть просто зашиты в файл теста.
Если нужно тестирование ещё и чтения файла — отдельный юнит тест (но т.к. скорее всего вы используете какой-нибудь стандартный API вам это не потребуется).
