уточните вопрос-вас интересуют платежные системы или же вы хотите,что бы клиенты оплачивали прямо по счету без комиссии?
если первое-то яндекс касса,робокасса,пейю,киви и т.д. Гуглите условия
если второе-то просто прикручиваете в "выбор способов оплаты" помимо "наличными" еще и "оплата по счету".
Интегрировать с 1С конечно можно,что бы автоматически человеку счет в ЛК формировался,но проще вручную отправлять,если конечно вы не работаете только с юр лицами