В вашем вопросе явно не указано, каким образом собранные сорцы будут выкладываться на хостинг (в новой схеме).
Просто на всякий случай уточню: если вдруг деплой будет делаться средствами git-репозитория (на хостинге будет клон репозитория), не забудьте в настройках сервера (apache, nginx, etc.) запретить доступ к директории .git через http, иначе вы рискуете засветить то, что видно быть не должно.
