Как известно, никто в здравом уме не хранит в репозитории файлы, получаемые в результате сборки.
Почему не хранят? В чем проблема? Системы контроля версий умеют хранить бинарные файлы, к тому же всякие конфиг файлы, changelog будут также в этой системе, что должно быть очень удобно. Ну а как хранить релизы - зависит от выбранной системы.
