1) переход не одно и тоже, что посетитель. Возможно вы смотрите уникальные хосты, а на самом деле их меньше, чем 100
2) Разные счетчики ведут себя по разному, и по разному обрабатывают данные
3) Возможно запоздание данных в счетчиках
4) Возможны у вас стоят какие-то фильтры в счетчиках
5) Скликивания и роботов никто не отменял
