Pytyle, описанной проблемы не имеет, из себя представляет реализацию тайлинга независимо от wm. Каждую новую версию автор переписывал.
pytyle2 фичастая, но тяжелая.
pytyle3 малофункциональная, но легкая как перышко. и к тому же имеет киллер фичу: поддерживает многомониторный форк опенбокса, почему и пользуюсь.
Работает с любым оконным менеджером.
Но лично я собираюсь переходить с KDE+openbox+pytyle на awesome, описанной вами проблемы там нет, настраиваемость абсолютная.