sbh

Хитачи очень надежные диски.
Его себе оставь.
WD - на продажу

Второго компьютера под рукой нет?
Если есть - отформатируйте диск на другом ПК и попробуйте подключите в ноутбук.

Хоть вы и написали уже ответ по поводу выкинуть, но все равно не могу не написать ИМХО.
Такой подход к решению проблемы - кривой костыль.
Можно провести аналогию с автомобилем. Когда у вас 2 и 4 передачи не работают но в принципе ездить можно.
С таким подходом вы будете терять файлы в том числе. Причем внезапно.
Подкопите денег и купите новый диск. Сектора умирают не просто так и со временем у вас диск умрет целиком.

Поищите на тостере. Был уже подобный вопрос.
Самое оптимальное не играться сейчас с диском пытаясь восстановить.
Так вы сделаете еще хуже. Несите профессионалам у которых есть соответствующее оборудование и знания.

А вы точно уверены что место израсходовала именно эта программа?
Думаю стоит сначала в этом определиться.

Вообще программа очень хорошая. Сам ей когда-то пользовался. Да и отзывы о ней только положительные.

Скорее всего проблема с контроллером. Но т.к. вы уже "снимали крышечку", то выбрасываем.

Руби процесс.
Так не бывает. Висит он уже намертво.

Читайте про IOPS, Zabbix,Nagios.

BIOS смотрели в плане настроек USB портов?