Папку App я не трогаю. В папке Resources создаю папку JS и храню все там. Если у вас только админка или какая-то часть только на Redux/React то можно и в одном проекте. Но все таки тенденция такова, что лучше разделять на два проекта, как сказали выше REST на Laravel и фронт отдельно и то нужно подумать зачем вообще Laravel если сразу можно на nodejs