Saboteur

Если стартовать mongod от юзера, то есть

sudo mongod --dbpath /mnt/share3 --bind_ip 127.0.0.1,10.1.1.32

Так это не от юзера, а от суперюзера (рута)

10.1.1.30:/mnt/pool/DBASE /mnt/share3 nfs rw,relatime,user,bg,hard,nolock,noatime,nointr 0 0

user позволяет обычному юзеру маунтить папку, правда я забыл не уверен какие права при этом получаются

Попробуй маунтить сразу от конкретного юзера

10.1.1.30:/mnt/pool/DBASE /mnt/share3 nfs rw,relatime,uid=mongouser,gid=mongouser,bg,hard,nolock,noatime,nointr 0 0

и /mnt/share3 должна принадлежать mongouser

Что значит "реализовать данный ip адрес"?

Тут указана небольшая подсеть /23 (512 адресов), возможно какой-то реальной организации. А может быть даже лажа админа 188.82.23.12, который вместо локальной подсети 172.16.1 прописал реальную 172.1.1

NFS - родной для Linux протокол, самба - родной для винды.
NFS - нативнее поддерживает файловые системы Линукс, samba - конвертирует.
NFS - будет заметно быстрее на множестве файлов, но передача крупных одиночных файлов в принципе сопоставима. Скорее всего замедление именно из-за работы с файловыми аттрибутами и правами доступа.

Я бы рекомендовал nfs.