Файлы не могут деградировать. Деградировать могут диски, но при этом файлы просто перестают читаться. Если файл прочитался (практически все форматы изображений, видео, музыки имеют контрольный код для сверки), то 99.9999%, что он точно такой же как и раньше.
Либо у вас что-то с софтом, которым вы открываете эти файлы.
Либо, как вариант, может какой-то вирус покоцал файлы, но я не знаю современного вируса, который бы портил их частично. Криптеры просто целиком криптуют.