В среднем, чем больше корпус, тем проще его охлаждать.
Комплектующие легче расположить. Вентиляторы более крупные (тихие) поставить.
Поток воздуха в большом корпусе движется тише за счет объемов.
Плюс большие современные корпуса и спроектированы лучше для воздухоотводов и крепления вентиляторов на разных стенках.