У нас та же проблема, только мы фрейм генерируем на стороне сервера (это не важно). Проблема именно при использовании iframe, без него Яндекс Браузер банковское приложение открывает без проблем как и прочие браузеры на Android.
Написано
Войдите на сайт
Чтобы задать вопрос и получить на него квалифицированный ответ.
