rutaka nashimo

www.omaroid.com/php-get-and-set-custom-http-headers

https://map.hexlet.io/stacks/php

Достаточно поставить SUID на скрипт, который будет менять конфиг, но рекомендую менять только определенные значения, не довать возможности записывать произвольный код, проводить очень строгую валидацию и ограничить доступ к web-ресурсу.