Смотря для чего оно вам. С технической точки зрения то бесплатные они и получше, но есть такая тема, что битрикс лучше продается. У них огромный пиар, тонна всяких брошурок, и дикие откаты реселлерам (до 50%). Так что для студии битрикс предпочтительней в плане прибыли.
А по поводу магазина, то все очень хвалят магнето, по статистике это самый популярный продукт в мире (сам с ним не работал личного впечатления нет), у него есть как платная так и бесплатная версия.