Mint не юзал
у самого стоит debian 7.8 и 8.2
что там что этам проблем с chromium и pepperflashplugin нет
поставить в неправильном порядке либо не можно, либо без разницы в каком
apt-get remove --purge chromium chromium* chromium-* pepperflashplugin-nonfree
должно зачистить всё не связанное с пользовательскими конфигурациями
в /var/cache/apt/ поищите deb-пакеты и того и другого по содержимому удалите все хвосты
если не верите менеджеру пакетов
надо замерить какой трафик идет при демонстрации на машину с форточкой, а какой на линь
если примерно одинаковый, то вся беда именно в отображении, а не в протоколах
будет запускаться каждую минуту в 7 часов каждого дня