Здравствуйте.
Если вы компилируете верстку к примеру из pug, slim => html, то тут придется от gulp отказываться, так как придется интегрировать верстку в php файлы шаблона, обмазать все это переменными и функциями php.
Gulp можно оставить для сборки js и css бандлов, icon шрифта и т.д., которые в дальнейшем будут подключатся в шаблон через functions.php.
Обычно это выглядит так.
У себя разворачиваете локальную копию сайта, запускаете ватчер gulp, работаете с исходниками js/css и вносите правки в php файлы шаблона (верстка).
