res2001

"Стандартные" реляционные базы данных подходят для большинства задач, их надо рассматривать в варианте по умолчанию.
Всю остальную "экзотику", типа монги, можно рассматривать только если по каким-то причинам не удовлетворяют реляционные БД. Часто NoSQL используется вместе с SQL, но для разных подзадач.
Слишком сильно и не очень заслуженно сегодня пиарят подход NoSQL.

В монге _id - это объект типа ObjectId (OID) - это 12 байтовое уникальное целое, уникальность гарантируется монгой, что-то вроде UUID или GUID.
Если его не задавать явно, монга сама его генерирует.
Монга автоматически создает уникальный индекс по _id в любой коллекции.
https://docs.mongodb.com/manual/core/document/#the...

Можно использовать aggregate, а там $unwind по массиву.
В конце, если нужно, можно заново сгруппировать.