Это плохая идея, даже если не задумываться о реализуемости.
Слишком много промежуточных шагов обработки, на каждом из которых будут свои отклонения от действительности. Идеально работает устройство на эмуляторе? Замечательно!
А эмулируется дрожь руки паяющего, наводки по питанию, паразитные взаимодействия? :)
Экономьте время и силы - сразу напрямую собрать макет, подключиться к устройству через JTAG и отлаживать его из студии. Потребуется микросхема с поддержкой JTAG, любую таким методом не поотлаживать.
easyelectronics.ru/vnutrisxemnaya-otladka-avr-cher...