В моем случае оказалось, что провод питания диска заблокировал один из вентиляторов видеокарты. В результате скорость оставшихся двух уходила в 100%, но датчик в том же GPU-Z не показывал скорость вращения и при выключении нагрузки вентиляторы не останавливались. Поправил провод и всё заработало.