В windows нужно перед началом команды прописать start /b , а также можно указать время выполнения дополнительной командой at в конце вашей команды... Также если смотреть в мануале по PHP про команду exec , то в первом комментарии можно увидеть код(функцию) для разделения команд на unix/windows машинах.
Написано
Войдите на сайт
Чтобы задать вопрос и получить на него квалифицированный ответ.