Добрый день!
В вашем случае лучше один счётчик на два сайта. Настройка зависит от версии аналитикса. Будем считать, что у вас последняя версия - gtag.js.
В таком случае манул будет такой:
https://developers.google.com/analytics/devguides/...
Если кратко, то на первом домене нужно прописать:
gtag('config', 'GA_TRACKING_ID', {
'linker': {
'domains': ['example.com']
}
});
А на втором:
gtag('config', 'GA_TRACKING_ID', {
'linker': {
'accept_incoming': true
}
});
Также рекомендую в аналитиксе в представлении создать фильтр, который будет в отчётах показывать все ссылки с доменами - очень удобно, мануал тут:
blog.evgenyprotasov.ru/?go=all/otobrazhnie-hostov-v-ua