Ваша ошибка в том, что нужно не просто провести линию, по которой будет производиться разрез (инструмент "перо"), но и сделать от этой линии еще один отрезок в сторону той части объекта, которая должна быть удалена. И использовать не "деление", в "вычитание".
Подробнее можно посмотреть на Youtube
https://youtu.be/nWamprxbjhs
Интересующий вас вопрос рассматривается на 6:00