Попробуйте не столь популярную, но весьма интересную и перспективную, как мне кажется систему.
Fossil. Это DVCS. Фактически в Windows, представляет из себя один исполняемый файл. Не мусорит в системе. Построен на основе sqlite3. Репозиторий — это один файл — база sqlite. С легкостью можно хранить хоть на flash. Включает в себя web интерфейс, сервер, wiki, bug tracking. Есть возможность автоматической синхронизации с удалёнными репозиториями. Доступ к ним через HTTP. Поддержка прокси. Работа в режиме собственного сервера, CGI, INETD. На нем ведётся разработка самого sqlite.