pofigizm

Можно добавить методов самим данным:

// создаем конструктор "класса" и нужные методы
    function Order(name) {  
      this.name = name;
    }
    Order.prototype.addChild = function () {
      this.parts = this.parts || [];
      var levelName = this.name + '-' + (this.parts.length + 1);
      this.parts[this.parts.length] = new Order(levelName);
    };
    Order.prototype.removeChild = function (index) {
      if (index === undefined) {
        delete this.parts;
      } else if (index > -1 && index < this.parts.length) {
        this.parts.splice(index, 1);
        if (this.parts.length === 0) delete this.parts;
      }
    };
    
//  имитация тех данных, которые приходят с сервера (в примере)
    var prepareOrders = [];
    prepareOrders[0] = new Order('part 1');
    prepareOrders[0]['_id'] = '123456';
    prepareOrders[1] = new Order('part 2');
    prepareOrders[1]['_id'] = '234567';

// Вставляем в $scope
    $scope.orders = prepareOrders;

и затем в вызовах ng-click можно обращаться к методам этих "объектов" и "под-объектов":

<a href='' ng-click='$parent.$parent.part.removeChild($index)'>Remove this</a>
<a href='' ng-click='part.addChild()'>Add child</a>
<a href='' ng-click='part.removeChild()'>Remove childs</a>

Вот так это работает:
embed.plnkr.co/DHEbQeyxySjOhk5kdlLh/preview

Как Вам такой вариант? Мне он больше нравится, т.к. эти методы вообще с сервера получать можно.

jsfiddle.net/D8U4j

Есть конечно один вариант с помощью таймера:

// ...
        link: function (scope, element) {
          setTimeout(function () {
            var html = '';
            angular.forEach(scope.orders, function (ord) {
              html += '<h4>' + ord.name + '</h4>';
            });
            element.append($compile(html)(scope));
            console.log('end of directive');
          }, 1000);
        }
// ...

Также можно внутри таймера проверять если данные пришли то выполнять, если нет то еще подождать.
Может быть есть более изящное решение?

++ еще через 1 час...

Нашел вариант который меня в принципе устраивает:

// ...
  .directive('orderDrct', ['$compile', 'Order',
    function ($compile, Order) {
      return {
        restrict: 'A',
        link: function (scope, element) {
          Order.query({id: 'all'}, function(orders) {
            scope.orders = orders;
            var html = '';
            angular.forEach(scope.orders, function (ord) {
              html += '<h4>' + ord.name + '</h4>';
            });
            element.append($compile(html)(scope));
          });
        }
      };
    }
  ])
// ...

т.е. перенести запрос к серверу в функцию линковки и в его коллбеке уже выполнить код.

Есть еще варианты?

Есть директива ng-Focus которая может вызвать таймер или еще чего-нибудь.
К сожалению нету события потери фокуса, поэтому тоже велосипед.