Нашел свой же старый вопрос и напишу ответ. Единственная причина такого поведения была в том что из за предшествующих перебоев в питании начались проблемы электрического кахарктера в одном из HDD. Это выносило мозг SATA контроллеру и он вел себя неадекватно. Заменили винт и теперь не используем те контроллеры, новые берем Adaptec у них таких проблем нет.
