Даже не представляю, в чём можно эффективно и гибко нарисовать схему такого масштаба. Самому интересно. Подозреваю, что будет примерно одинаково неудобно при любом выборе.
Если Вам важны именно связи между сущностями и их свойства, то надо искать именно софт для построения ER-диаграмм (
вот тут нехилый такой список).