Опишу средне: сначала, при загрузке страницы, нужно сделать так, чтобы логотип был скрыт. Можно написать для него особый класс стиля.
Затем, с помощью js навешиваете listener, который наблюдает, пока пользователь не прокрутит страницу на x пикселей.
После этого у логотипа меняете класс, чтобы он стал виден.
В интернете полно рецептов такого кода, правда он в основном про то, как сделать шапку сайта фиксированной при прокрутке. Там же обычно подробная инструкция, что как и где.
Берите любой понравившийся и используйте на здоровье.
