ее там и не будет, ибо все надо было делать по-порядку: склонировали репозиторий git clone, удалили папку git допустим, инизиализировали свой проект git init,
сделал так.
После этого гит должен был увидеть новую папку и добавить ее. Но он ее не видит.
ну так я об этом. Ситуация такая. У меня репозиторий /home/myRepo. Я клонирую в него чей-то репозиторий /home/myRepo/folder/someRepoFromWeb. Удаляю /home/myRepo/folder/someRepoFromWeb/.git . Получаю, что в моем home/myRepo есть всего лишь папка /home/myRepo/folder/someRepoFromWeb. Свой репозиторий я не порушил. /home/myRepo/.git я не трогал.