Спасибо за ответ Зелим Бельтоев! Но не включенно. Я всё таки разобрался ... ответ как всегда был прост, проблема была в модификаторах, которы нужно было просто удалить. Они как оказалось работают как кеш. У меня же они находились (system/storage/modification/) удалил содержимое папки и все изменения применились.
Всем спасибо! :)

Для справки:
"Модификаторы - специальные файлы xml в которых есть инструкции по изменению файлов. Но сами файлы не меняются, меняются их виртуальные копии. Более подробно описано в руководстве разработчика.
Но для начала совсем не об этом. Бывают случаи когда вы то и дело изменяете основные файлы, а изменения не происходят. Скорей всего, виной является как раз виртуальная копия файла (созданная каким либо модификатором), которая находится по пути ваш-сайт\system\modification\ или в Меню - Модули - Модификаторы
Для того чтобы обновить кеш модификатора, необходимо перейти в Меню - Модули - Модификаторы нажать Обновить"