p4s8x

Удаление связанных данных отлично решается - используя CASCADE в БД.
Для массовых удалений\апдейтов есть UpdateAll DeleteAll и подобные методы AR.

Можно вместе с миграцией залить дамп и написать миграцию-скрипт в 3 строчки, который выполнит весь дамп.