Столкнулся с аналогичной проблемой, не работали ни выпадающие списки, ни выпадающая навигация при открытии на мобильном телефоне.
Спасибо Роман @paradokso за наводку.
Необходимо подключать JQuery перед bootstrap.min.js, но, при просмотре консоли выдало ошибку, что версия JQuery должна быть не ниже 1.9 и не выше/равна 3.0.
После того как поставил версию JQuery в этом диапазоне, все заработало.
