У тебя второе условия срабатывает, когда уже на другой ступене цикла.Например, ты ввел "c", он его сравнил с первым индеском списка ("с" равно "с") записал его .И потом перешел на сравнения условия второй итерации, где "с" уже не будет равно "а", и потом "c" не будет равно "t".Поэтому ты получаешь два алерта с "no".