В вопросе слишком много нюансов:
чтобы смоделировать биологический организм программным путем и проводить над ним
то есть это многоклеточный организм?
Мне нужно построить приложение, которое из одной клетки, путем деления, выращивает миллионы самостоятельных клеток
но тогда клетки этого организма не могут быть самостоятельными(они дифференцированы в ткани и органы) и деление строго регулируется гуморальной системой организма — иначе это раковая опухоль.
