Считаю, что можно иметь в сети несколько серверов DHCP, только бы пулы не пересекались.
По сути вопроса, в посте не сказано какой из конфигов настраивался. После установки установки LTSP в дирректории /etc/ появляется два DHCP
1) родной - /etc/dhcp/dhcpd.conf
и
2) LTSP - /etc/ltsp/dhcp.conf
Второй и становится главным после установки LTSP, его конфиг и нужно править.