Все я разобрался. Protoc не распознает кириллицу, поэтому путь к файлу такой как:
"C:\Users\Никита\source\repos\Billing\Billing\"
он не мог распознать, и видел как:
"C:\Users\═шъшЄр\source\repos\Billing\Billing\"
Поэтому я просто сменил имя системной папки: (поковырявшись в настройках Windows)
"C:\Users\Nik\source\repos\Billing\Billing\"