Олег Шулепов

Подобного вида работы хорошо запускать через screen или более современный вариант - tmux как выше посоветовал Дмитрий Беляев

Послушайте совет CityCat4
Лучше нанять специалиста. С большой степенью вероятности Вы в лучшем случае не справитесь, а в худшем - потеряете сайт/базу данных.

ssh

Скорее всего загрузчик установлен не тот диск.

С чтения хороших книг по Linux:
Brian Ward "How Linux Works" или по русски Брайан Уорд "Внутреннее устройство Linux"
Немет Э., Снайдер Г., Хейн Т. - Unix и Linux. Руководство системного администратора
Уильям Шоттс - Командная строка Linux

Читаете, повторяете все примеры до полного прояснения.