netruxa

оно и с ПК пишет, что не защищено https://yadi.sk/i/jH5qduZME4ASdg
сертификат самоподписанный чтоли? поменяйте на любой другой. например, lets encrypt

на беглый взгляд надо все проверки типа
if (check[0,1,2].innerHTML == 'x') {
заменить на
if (check[0].innerHTML == 'x' && check[1].innerHTML == 'x' && check[2].innerHTML == 'x') {

будет работать, но как то грязно это все. думаю, можно поэлегантней решение найти

Отключите Счётчик товаров в категории, если включен

может быть все что угодно - например, файл стилей не докачался и пустой
или в header.tpl он не подключается
или протокол у сайта http, а заходите по https

покажите сайт

как вариант, засунуть этот код в фунцию
var elem = document.createElement('script');
elem.type = 'text/javascript';
elem.src = '//адрес до скрипта';
document.getElementsByTagName('body')[0].appendChild(elem);

и вызвать ее