Если есть понимание, зачем нужен advanced, то откуда такие вопросы?
Формально вот ссылка на репу, там все указано:
https://github.com/yiisoft/yii2-app-advanced/blob/...
Чуть менее формально - в backend кладется админка, в frontend - сам сайт, в common - общие классы.
Краткая инструкция (требуется composer и гитхаб может попросить сгенерировать токен):
$ composer global require fxp/composer-asset-plugin
$ composer create-project yiisoft/yii2-app-advanced # токен может потребоваться здесь
$ cd yii2-app-advanced
$ ./init # тут отвечаем на вопросы
$ ls frontend/web
$ ls backend/web
