Нашел решение, по крайней мере производительность выросла и SIGBUS больше вообще не встречается.
Во первых:
#/etc/php5/fpm/pool.d/www.conf
pm.max_children = 80 << 2000Mb (total_fpm_memory) / 25Mb (one fpm process memory usage)
pm.max_spare_servers = 20
pm.max_requests = 200
Это в целом улучшает стабильность, параметры расчитываются индивидуально
в этом же файле временно можно включить и посмотреть медленные запросы:
#slowlog = /var/log/php-fpm-slow.log
#request_slowlog_timeout = 5s
#listen.backlog = -1
Далее:
#/etc/php5/conf.d/apc.ini
[APC]
extension = apc.so
apc.enabled = 1
apc.shm_segments = 1
apc.shm_size = 256
apc.optimization = 0
apc.num_files_hint = 10000
apc.user_entries_hint = 10000
apc.ttl = 0
apc.user_ttl = 0
apc.gc_ttl = 600
apc.cache_by_default = 1
apc.filters = "apc\.php$"
apc.slam_defense = 0
apc.use_request_time = 1
apc.mmap_file_mask = /tmp/apc.XXXXXX
apc.file_update_protection = 2
apc.enable_cli = 0
apc.max_file_size = 5M
<b>apc.stat = 0</b>
apc.write_lock = 1
apc.report_autofilter = 0
apc.include_once_override = 0
apc.rfc1867 = 0
apc.rfc1867_prefix = "upload_"
apc.rfc1867_name = "APC_UPLOAD_PROGRESS"
apc.rfc1867_freq = 0
apc.localcache = 1
apc.localcache.size = 512
apc.coredump_unmap = 0
apc.stat_ctime = 0
Тут на самом деле ключевой была только настройка apc.stat = 0, остальное можно выкинуть
Собственно именно добавление apc.stat = 0 позволило устранить SIGBUS ошибку, теперь в логах только уведомления о том что дочерние процессы перезапускаются (из-за pm.max_request)
