Дпустим форкнули github.com/rails/rals получили github.com/sl_bug/rails. Склонили, Написали что-то. и дальше такая конструкция:
1. git remote add rails_orig git://github.com/rails/rails.git
2. git fetch rails_orig
3. git merge rails_orig/master (нада бы еще rebase сделать)
4. правим конфликты если есть
5. git push origin master