Андрей Саныч

Prestashop - работал когда-то с ней. Если хотите постоянного секеса с кодом - это ваш выбор.
Wordpress - можно поставить WooCommerce, из коробки базовые вещи есть
Opencart - хороший выбор, но надо поставить несколько платных и бесплатных нормальных модулей, чтобы некоторые вещи работали как положено.
ModX для магаза - ИМХО, извращение

Вывод, я бы посмотрел либо на Wordpress, либо на Opencart. По безопасности Opencart норм, за WP не знаю

установите proftpd. Это просто. Потом с помощью команды добавляете юзера

ftpasswd --passwd --file=/etc/proftpd/ftpd.passwd --name=your_user_name --uid=33 --gid=33 --home=/var/www/test.ru --shell=/bin/false

uid и gid - это обычно идентификаторы группы www и юзера www, от имени которого работает веб сервер