Автору уже вряд ли актуально, но вдруг кто-то придет сюда из гугла.
Недавно появилась альтернатива, написанная на php -
php-xdebug-proxy. В вопросе не озвучено, какие именно проблемы есть в pydbgpproxy, но php-xdebug-proxy написан на php, а значит при желании её можно расширить или исправить проблему используя хорошо знакомый язык.