в settings дописать:

"emmet.syntaxProfiles": {
    "html": {
      "filters": "html, bem"
    }
  },
  "emmet.preferences": {
    "bem.elementSeparator": "__",
    "bem.modifierSeparator": "--",
    "bem.shortElementPrefix": "-",
    "lorem.defaultLang": "en"
  },

синтаксис такой:

По поводу второго вопроса, надо курить настройки emmet, а именно фильтры

filter.commentTrigger: - list of attributes that should trigger comment output. Default value is id, class

И в vscode, в "emmet.preferences": {} прописывать то, что вы хотите видеть в комменте
Например:

"emmet.preferences": {
    "filter.commentBefore": "<!-- [#ID][.CLASS] -->\n",
    "filter.commentAfter": "\n<!-- [#ID][.CLASS] end -->"
},

Ещё, чтобы не писать постоянно |c для вывода коммента, можно опять же дописать настройку:

"emmet.syntaxProfiles": {
    "html" : {
      "filters" : "html, c"
    }
},