Сработало!!! Спасибо Руслан.
Если вдруг кому то пригодится. Небольшой мануал:
Системные настройки -> tagmanager2. Нам понадобятся ключи параметров, имя и значение . Далее идем в Контексты -> клик пкм eng (контекст английской версии) -> Редактировать -> Настройки контекста -> Создать новый
Сохраняем. Далее создаем еще один параметр, но уже водим данные для "ID ресурса каталога верхнего уровня" и в значение вводим id корневого каталога английской версии.
Тоже самое проделываем для контекста web (русской версии).
После этого заработают фильтры, но с небольшим НО: для настройки или обновления фильтров конкретного контекста, например eng, нужно будет в настройках tagmanager2 (Системные настройки -> tagmanager2) менять значение параметров "Контекст каталога товаров" на eng и "ID ресурса каталога верхнего уровня", в моем случае, на 48. После этих манипуляций идем в Приложения -> Управление фильтрами (ТМ2) и справа будет отображаться дерево каталога контекста eng (английской версии). Если нужно поменять настройки фильтров русской версии, то лезем снова в настройки, меняем значения на соответствующие русскому контексту и вуаля.
Надеюсь понятно объяснил)
