Когда вы к серверу подключаетесь через путти, приватный ключ лежит там, где путти.
А когда вы уже зашли на удаленный сервер, и юзером1 пытаетесь подключиться к юзеру2, то приватные ключи должны лежать у юзера1.
Вы можете уже внутри юзер1 сгенерировать новый ключ, и положить публичный от него в юзера2.
Или конвертнуть приватный ключ из путти в формат для ssh и положить его в юзер1