Для тех кто окажется тут. Если вы хотите, чтобы ненужные клоны удалялись Destroеm и процесс не прерывался, то необходимо гэйм обжиг удалить из компонентов главной сцены в юнити в левом верхнем меню.(при этом gameObject должен лежать в отдельной папке проекта и быть назначен оттуда на скрипт)