Тебе нужно в компоненты лезть и найти компонент, отвечающий за вывод элементов каталога на сайте. Обычно это "Каталог" или "Товары".
По пунктам че надо делать:
1. Открыть редактор шаблонов Битрикса и найти шаблон компонента для вывода элементов каталога;
2. В шаблоне найти место, где отображается цена товара, и определить, какие разделы каталога требуют отображения цены в штуках, а какие в рублях;
3. Добавить условные конструкции в шаблон, чтобы определить, какую подсказку отображать в зависимости от раздела. Под условиями я имею ввиду скрипт написать);
4. Сохранить изменения в шаблоне и обновите страницу с каталогом, все).