Чтобы слить линии - переведите их в кривые (Ctrl+Shift+O), а потом уже сливайте их вместе.
А вот оранжевые пятна придётся сливать отдельно.
Т.е. судя по вашей иллюстрации будет 3 объекта. Меньше уже точно никак.
После сохранения в SVG и открытия в illustrator, они будут лежать в одном слое, но 3 разных объекта
